Ответы:
--------- 1. Можно, такой способ называется локальный дивайд. Подробно здесь - http://zbrush.3dn.ru/forum/5-9-2 пост № 30
2. Рендер в Браше не совсем привычный. Обычно состоит из следующих этапов. Назначение материалов, установка света, настройка теней, рендер отдельных каналов (дифуз, спекуляр и т.д.) для последующей сборки в Фотошопе. Чтобы получить "финальную" картинку в палитре Render нужно выбрать Best. Здесь довольно подробно про рендер в Браше - http://www.pixolator.com/zbc/showthread.php?t=48583
3. Исправить другой оттенок активного сабтула очень просто. Нужно всего лишь назначить сабтулам материалы (по умолчанию материал не назначен и автоматически меняется как только вы выбираете любой материал из палитры)
4. ZProject много для чего - например вот - http://www.zbrush.info/docs/index.php/Tutorial:ZProject_Texturing