Чего-то где-то краем уха слышал. Вроде есть такое, что топологию за раз нужно перестраивать иначе потом режим этот работать не будет. Не уверен, сейчас гляну баг это или фича... Ага, нашёл! Ситуация похожа, но на практике проверить не могу сейчас. Вот перевод:
"Если вы сохраните модель на этапе ретопологизации, то загрузив её позже не сможете редактировать топологию. Решение - в Tools->Topology отжать кнопочку Edit Topology, а затем нажать её снова, это действие активирует режим Edit Topology. После этого возможность модифицировать топологию должна включиться."
Вобщем попробуйте сами и отпишитесь работает ли.